蛋孵化是培育强力宝可梦的重要环节。首先需要将两只符合繁殖条件的宝可梦放入孵化场，它们必须属于同一蛋组且性别不同。孵化场位于华蓝市南部的第四路，通过迪格利特洞窟和11号公路即可到达。放入后，工作人员会照料它们，若兼容则可能产卵。需部分特殊宝可梦如传说类无法繁殖，且蛋组分类决定了兼容性，例如水1组或怪物组的宝可梦才能配对。
获得蛋后，需将其携带在队伍中并通过行走积累步数来孵化。不同宝可梦的蛋所需步数差异较大，普通种类可能较快，而稀有种类则需要更多时间。行走时使用自行车或飞行技能可提升效率，但需避免频繁遭遇野生宝可梦打断进程。队伍中若有具备火焰之躯特性的宝可梦（如鸭嘴火龙），能显著减少孵化所需步数，这是优化流程的关键技巧。
亲密度较高的宝可梦不仅更容易产卵，还可能间接提升孵化效率。虽然游戏未明确说明其对孵化的直接作用，但维持亲密度仍被视为良好实践。孵化完成后，新生宝可梦的性别、个体值等属性会随机生成，玩家可通过反复繁殖筛选理想属性。若需批量孵化，建议提前规划路线并准备多只火焰之躯特性的宝可梦以节省时间。
将宝可梦寄放期间可能持续产卵，且无明确数量限制，因此需定期取回已孵化的蛋以避免堆积。取回时需支付少量培养费用，但成本可控。蛋孵化系统为玩家提供了深度培养宝可梦的途径，结合步数管理、特性利用和亲密度维护，能够高效完成目标。
