顶级忍者的选择需要综合考量技能机制、实战表现和操作难度。宇智波带土（仙人模式）凭借万花筒写轮眼的特殊机制稳居第一梯队，其技能组合兼具抓取、爆发和生存能力，尤其在决斗场中能通过黑洞吸附和树枝攻击形成压制力。漩涡鸣人（九尾模式）则依靠高机动性和爆发伤害成为热门选择，九尾化状态下的连招衔接流畅，适合快速终结对手。宇智波佐助（须佐能乎形态）同样属于顶尖梯队，写轮眼瞳术与皆杀之刃的组合能实现高额输出，但需要较高的操作精度。
技能强度与战斗风格是评判忍者的核心标准。佩恩天道超凭借攻防一体的技能机制成为版本主流，神罗天征的防御反击和地爆天星的控制效果使其在高端局表现突出。秽土鼬虽然削弱后跌落T0，但其幻术反制和奥义斩杀能力仍具备竞争力。千手纲手作为辅助型忍者，通过治疗和霸体技能为团队提供续航，但输出能力稍显不足。暴怒带土与疾风咒印佐助虽同属点券忍者，但前者因简单操作和保底反三能力更受青睐。
忍者梯度会随平衡调整动态变化，但部分角色始终占据高位。宇智波斑（全新形态）凭借范围伤害和生存能力适应多种战斗场景，而大蛇丸的持续压制和替身规避机制使其在消耗战中表现优异。面具男因喷火位移和神威空间增伤成为中远程战术代表，但后摇问题需要玩家通过预判弥补。日向雏田的白眼血继限界在近身战中优势明显，但缺乏远程起手手段。
新手与高阶玩家的选择策略存在差异。自来也、二代水影鬼灯幻月等忍者因操作简单且普攻稳定，适合入门玩家快速上手。而秽土柱间、晓组织大蛇丸等需要精准技能释放的忍者，则更考验玩家的节奏把控。组织战和跨服玩法中，团队型忍者如漩涡博人、我爱罗（忍战形态）能通过控场和AOE伤害影响战局。顶级忍者的价值取决于玩家对其机制的掌握程度，而非单纯依赖强度排名。
优先升级主力忍者的核心技能，合理搭配勾玉和秘卷以弥补短板。饰品属性应侧重攻击加成，避免虚战力的暴击堆砌。通过日常任务和决斗场积累资源，逐步完善忍者阵容的全面性。忍者强度仅为实战中战术执行和临场反应往往比角色选择更具决定性。
